Le conseil national comporte 12 membres. Sur ces 12 membres :

• 6 sont élus par les étudiants
• 6 sont élus par des post universitaires qui sont passés par les GBU pendant leurs études.

Son rôle est de veiller à l'orientation générale de l'association, de gérer le personnel, les finances, les immeubles et de représenter les GBU à l'extérieur de l'association.